我公司做研发项目的，支付费用，取得增值税专用发票，可以抵扣吗？会计分录该怎么做呢？

一、营业税改增值税取得的发票抵扣　　一般纳税人：支付给非试点纳税人取得的发票(营业税票)能抵扣吗?不能，但是如果你是实行差额纳税的企业，由非试点纳税人取得的营业税票可以作为差额纳税抵扣。　　一般纳税人提供应税服务，试点期间按照营业税改征增值税有关规定允许从销售额中扣除其支付给非试点纳税人价款的，应在“应交税费——应交增值税”科目下增设“营改增抵减的销项税额”专栏，用于记录该企业因按规定扣减销售额而减少的销项税额;同时，“主营业务收入”、“主营业务成本”等相关科目应按经营业务的种类进行明细核算。　　企业接受应税服务时，按规定允许扣减销售额而减少的销项税额，借记“应交税费——应交增值税(营改增抵减的销项税额)”科目，按实际支付或应付的金额与上述增值税额的差额，借记“主营业务成本”等科目，按实际支付或应付的金额，贷记“银行存款”、“应付账款”等科目。　　对于期末一次性进行账务处理的企业，期末，按规定当期允许扣减销售额而减少的销项税额，借记“应交税费——应交增值税(营改增抵减的销项税额)”科目，贷记“主营业务成本”等科目。　　小规模纳税人：取得的试点纳税人发票能抵扣吗?不能抵扣，小规模纳税人实施简易计税法，适用3%的征收率计税，不能抵扣进项税额。　　取得的非试点纳税人发票能抵扣吗?不能抵扣，但是实行差额纳税的企业，由非试点纳税人取得的票可以作为差额纳税的抵减额。　　小规模纳税人提供应税服务，试点期间按照营业税改征增值税有关规定允许从销售额中扣除其支付给非试点纳税人价款的，按规定扣减销售额而减少的应交增值税应直接冲减“应交税费——应交增值税”科目。　　企业接受应税服务时，按规定允许扣减销售额而减少的应交增值税，借记“应交税费——应交增值税”科目，按实际支付或应付的金额与上述增值税额的差额，借记“主营业务成本”等科目，按实际支付或应付的金额，贷记“银行存款”、“应付账款”等科目。　　二、营业税转增值税后怎么做分录　　借：销售费用1000　　进项税金60　　贷：银行存款1060　　需注意的是，6%适用的是“部分现代服务业”(其中含交通运输业辅助业，也就是货代等行业)而不是“交通运输业”。“交通运输业”适用11%。