主要区别有两点：

1、参保方式不同：参保单位与职工建立劳动关系进行参保，参保职工从参保缴费当月起享受医保待遇。

城乡居民医保集中参保，享受待遇时间为次年的1月1日至12月31日。

2、参保对象不同：城镇职工医保，本市行政区域内的城镇所有用人单位，均应参加城镇职工医保。

城乡居民医保：覆盖了所有无其他基本医疗保障的本市户籍城乡居民。

灵活就业医保和职工医保的报销比例

灵活就业医保和职工医保的报销比例如下：

1、门诊报销比例标准：

（1）村中心卫生室就诊看病，报销比例标准是百分之60；

（2）镇卫生院就诊看病，报销比例标准是百分之40；

（3）二级医院就诊看病，报销比例标准是百分之30；

（4）三级医院就诊看病，报销比例标准是百分之20。

2、住院报销比例标准：

（1）辅助检查药费报销比例标准：心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费限额报销；

（2）手术费报销比例标准：参照国家标准，超过1000元的按1000元报销；60周岁以上老人在卫生院住院，治疗费和护理费每天有补偿；

（3）住院各级医院报销比例标准：镇卫生院报销比例是百分之60；二级医院报销比例是百分之40；三级医院报销比例是百分之30。

3、大病报销比例标准：

（1）参加了医保缴费的，大病报销比例一次性或者全年全年医疗费用超过5000元以上将分段进行补偿；

（2）参加了医保缴费的，大病报销比例一次性或全年医疗费超过5000元以上分段将分段进行补偿；

（3）参加了医保缴费的，镇级合作医疗住院及尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗补偿一年报销比例限额。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十三条

职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。

无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。

《社保法》第二条，国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。