交通事故住院新农合一般是不会报销的，交通事故是属于第三方费用，不在家庭村合作医疗报销范围内。只有在交通肇事者不支付或者行为人无法确定的情况下，新农合基金才应当按照规定的比例先行支付，新农合基金垫付后，有权向第三方索赔。

一、新农合报销流程：

1、参合农民持新农合证在定点机构门诊治疗，由定点医疗机构按新农合证家庭门诊帐户诊帐户现有的金额直接减免医药费用；

2、参合农民在市、县、乡定点医疗机构住院治疗的，由该定点医疗机构进行直补；

3、申领补偿时，需带身份证、户口本、新农合证医疗机构的有效住院发票、出院小结、费用清单和转诊证明；

4、患门诊大病的参合农民在规定时间，带领相关材料到乡农医所办理；

5、住院费用实行限时报结制度，出院后三个月内可随时办理补偿结算手续，超过三个月的视为自行放弃补偿。

二、新农合报销需要的材料：

1、住院报销需提供的证件包括，户口本或身份证、新农合参合缴费票据、住院发票、诊断证明、费用清单、住院病历；

2、普通门诊慢性病报销需提供的证件包括，户口本、慢性病就医证、新农合参合缴费票据、普通门诊复式处方、门诊交费发票；

3、大病统筹报销需提供的证件，户口本、新农合参合缴费票据、住院发票、诊断证明、费用清单、住院病历、合疗首次报销凭证。

交通事故走新农合报销的后果

交通事故走新农合报销，会侵犯公共利益，会违背新农合的初衷，使农民的基本卫生服务得不到保障。如果构成骗保，将受到以下的处罚：

1、如果故意隐瞒车祸事实，不履行告知义务，新农合会解除其保险合同，并不退还保费；

2、虚构保险标、编造虚假事故原因、故意造成财产损失或故意造成保险受益人死亡，从而骗取保险金的，要承担相应的刑事责任；

骗保金额较大的，处1万元以上10万元以下的罚款，并处5年以下有期徒刑或拘役；

骗保金额巨大的，处2万元以上20万元以下的罚款，并处5年以上10年以下的有期徒刑；

骗保金额特别巨大的：处2万元以上10万元以下的罚款，并处10年以上的有期徒刑。

《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十一条：

被保险机动车发生道路交通事故造成本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡、财产损失的，由保险公司依法在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。