1、公司通过股权转让的方式低价回购股份的行为是不合法的。

2、根据相关法律规定，公司只有在法定情况下才能够回购自己公司的股权，比如将股份用于员工持股计划或者股权激励。

3、法律依据：《中华人民共和国公司法》

第一百四十二条，公司不得收购本公司股份。但是，有下列情形之一的除外：

(一)减少公司注册资本；

(二)与持有本公司股份的其他公司合并；

(三)将股份用于员工持股计划或者股权激励；

(四)股东因对股东大会作出的公司合并、分立决议持异议，要求公司收购其股份。

第十六条，公司向其他企业投资或者为他人提供担保，依照公司章程的规定，由董事会或者股东会、股东大会决议；公司章程对投资或者担保的总额及单项投资或者担保的数额有限额规定的，不得超过规定的限额。

公司为公司股东或者实际控制人提供担保的，必须经股东会或者股东大会决议。

前款规定的股东或者受前款规定的实际控制人支配的股东，不得参加前款规定事项的表决。该项表决由出席会议的其他股东所持表决权的过半数通过。

一、法律对股权转让有哪些限制

1、根据公司类型的不同，法律对股权的转让有不同的限制。

2、就有限责任公司而言，股权转让分为内部转让和外部转让两种。

（1）内部转让完全自由，而外部转让则需要经过半数的其他股东同意，并且其他股东有优先购买权。

（2）公司章程对股权转让另有规定的，从其规定，因此公司章程中如果对股权转让有不违反法律强制性规定的特殊规定，则以公司章程的规定为准。

3、就股份有限公司的股权转让限制而方，主要有以下几点：

（1）发起人持有的本公司股份，自公司成立之日起一年内不得转让。

（2）公司公开发行股份前已发行的股份，自公司股票在证券交易所上市交易之日起一年内不得转让。

（3）公司董事、监事、高级管理人员所持本公司股份自公司股票上市交易之日起一年内不得转让。

（4）公司董事、监事、高级管理人员任职期间每年转让的股份不得超过其所持有本公司股份总数的百分之二十五。

（5）公司董事、监事、高级管理人员离职后半年内不得转让其所持的本公司股份。

4、所以针对低价转让股权是否合法这个问题来说，需要分情况对待，一般企业股东转让股权是没有限制的，即使其无偿转让都是可以的，但是，如果涉及到国有资产的股权，其股权涉及到国家资产及国民利益，需要谨慎去处理。