一般不能注销，在公司涉及的债权债务关系还在法院诉讼期间，若公司进行注销登记，则无法保证对该案所涉及的债权债务关系进行合理的清算和处理。债权人无法及时依法参与到债权分配中，直接导致债权人的权益难以实现。

一、公司清算剩余财产分配程序

程序是先成立清算组，并办理备案，再通知、公告债权人，并且进行债权申报和登记，然后清理公司财产，编制资产负债表和财产清单，制定清算方案，报股东会或法院确认，最后执行清算方案，分配财产。

公司解散清算的，清算组应当自成立之日起10日内将清算组成员、清算组负责人名单向公司登记机关备案。

备案应提交以下材料：

1、公司清算组负责人签署的公司备案申请表；

2、清算组人员基本情况，公司签署的授权委托书；

3、股东会关于成立清算组的决议；

4、公司企业法人营业执照副本复印件。

清算组应当自成立之日起10内通知债权人，并于60日内在报纸上公告。通知和公告内容应包括公司名称、住所、法定代表人、注册号、注销原因、清算开始日期、清算组人员及工作地址、申报债权的期限、地点和注意事项等。债权人应当自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，向清算组申报其债权。债权人申报债权，应当说明债权的有关事项，并提供证明材料。清算组应当对债权进行登记。在申报债权期间，清算组不得对债权人进行清偿。

清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民法院确认。

二、公司清算的清偿顺序

公司清算中剩余财产的分公司清算的清偿顺序配，应当遵循以下规则，即有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。这里所指的剩余财产，是指公司财产按照法定的清偿顺序清偿公司债务后的剩余财产，未作清偿的不得分配。

公司财产能够清偿公司债务的，分别支付清算费用、职工工资和劳动保险费用、缴纳所欠税款。清偿公司债务。这是公司清算时，公司财产的法定清偿程序，它是根据公司债务的性质，全面衡量其轻重而确定的，与一般的债务清偿顺序是不一样的，应当重视其特点。

公司在清算期间，不得开展新的经营活动。

清算方案的主要内容包括：清算日期，清算程序，清算方法，财产作价和清算的依据，债务清偿，剩余财产分配等事项。

清算方案的主要内容包括：清算组的成立情况、清算工作的开展、资产及负债情况、债务的处理、剩余财产的分配等。