一、怎样确定运输合同纠纷管辖法院

1、在铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同发生的纠纷，不同于一般的合同纠纷，即包括一方不履行合同发生的纠纷，如无故拖延运输期限，又包括在运输过程或者到达目的地时，托运的物品被损坏、丢失，或者对运输工具、设备造成损害，以及旅客人身遭受损害所发生的赔偿纠纷。因此，与《民事诉讼法》第24条和25条规定的合同纠纷。这类合同纠纷，可能发生在运输合同始发地、中转地、也可能发生在运输到达地。当事人因为上述运输合同发生纠纷，经过双方协商，可以自行解决，也可以向仲裁机构申请仲裁。如果提起诉讼，根据我国《民事诉讼法》第28条规定，因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖。

2、运输始发地、是指货物运输的发运地或者旅客乘运地。目的地，是指货物或者旅客到达地。上述3个地方各人民法院对这类运输合同纠纷都有管辖权，当事人到任何一个法院起诉都可以。有管辖权的人民法院不得无故推托，应当依法受理。对两上以上有管辖权的人民法院，当事人只能选择其中一个法院起诉，由最先受理的人法院审理。

二、运输合同纠纷怎么处理

1、协商

运输合同纠纷出现后，大多数情况下，合同当事人双方会考虑到多年良好的合作关系和商业因素，互相退一步，争取友好协商调解，在此基础上达成和解协议，解决纠纷。

公路旅客运输合同纠纷怎么解决

2、调解

但也会有一部分纠纷经过双方较长时间协商还是无法解决的，可以要求有关机构调解，如果一方或双方是国有企业的，可以要求上级机关进行调解。上级机关应在平等的基础上分清是非进行调解，而不能进行行政干预。

3、仲裁

合同当事人协商不成，不愿调解的，可根据合同中规定的仲裁条款或双方在纠纷发生后达成的仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。

4、诉讼

如果合同中没有订立仲裁条款，事后也没有达成仲裁协议，则通过法院进行诉讼是解决纠纷最终的途径。运输合同纠纷可以按照我国的诉讼程序，由一方或双方向有管辖权的法院起诉，然后由法院根据适用法律和事实进行审理，最后作出判决。