分摊到所属月份扣税。

关于关于补发工资个人所得税问题，国家税务总局在这方面没有明确规定，根据《个人所得税法》的规定，个人应于取得所得时缴纳个人所得税，因此，所在单位补发工资，应于补缴当月缴纳个人所得税。对此，各地有具体规定，按照各地的规定，补发的工资，应当分摊到所属月份与原工资合并计算扣缴个人所得税。

计算公式为：

所属月份补发工资应纳税额＝｛［（所属月份补发工资＋原所属月份的工资薪金所得）——个人应纳的五险一金——费用减除额］×适用税率－速算扣除数｝——原所属月份已缴纳的个人所得税。

一、补发工资扣税注意事项

注意以下三个关键点：

1、必须合理说明补发理由

政策性调资、职务晋升、新员工定级、单位筹建期或资金困难等原因各异，表现不同，证据也有差别，应具备合理性并能够证明真实性。

2、应在会计处理上相互呼应

这里分为两种情况：

第一，因资金困难原因的，当月工资正常计提，但未能实际发放，但会计入账能够显示各个月份工资计提的处理环节，自然没有问题；

第二，因其他原因补发的，比如员工评级引发的工资补发，在各个月份可能未做计提（因不知道能否评上），年末根据业绩评定级别补发工资，会计上要不要做调整处理？实务中也是态度不同，我的建议是既然要分摊计入各月，自然也应当会计进行调整，以实现会计处理和个税处理的统一。

3、是否需要到税务机关备案

实务中也是很不统一，我们的建议是，各地有明确规定，按照当地规定，如果当地没有明确规定，看金税三期个人所得税扣缴系统客户端能否接受调整补缴，如果能够直接处理留好资料即可。如果不能或者超出调整时间期限，应到税务机关备案处理。

二、个人所得税的税率如何

个人所得税根据不同的征税项目，分别规定了三种不同的税率：

综合所得（工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得，特许权使用费所得），适用7级超额累进税率，按月应纳税所得额计算征税。该税率按个人月工资、薪金应税所得额划分级距，最高一级为45％，最低一级为3％，共7级。

经营所得适用5级超额累进税率。适用按年计算、分月预缴税款的个体工商户的生产、经营所得和对企事业单位的承包经营、承租经营的全年应纳税所得额划分级距，最低一级为5％，最高一级为35％，共5级。

比例税率。对个人的利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得，偶然所得和其他所得，按次计算征收个人所得税，适用20％的比例税率。